РАЗНООБРАЗИЕ И МЕТАБОЛИЧЕСКИЙ ПОТЕНЦИАЛ МИКРООРГАНИЗМОВ ИЗ ПОЧВ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННОГО НАЗНАЧЕНИЯ
Боковая панель статьи
Основное содержимое статьи
Аннотация
Представлены данные о микробиологическом, молекулярно-генетическом анализе почвенного микробного сообщества. Объектами исследования являлись образцы почвы сельскохозяйственного назначения, отобранные на различном расстоянии (50, 75 и 100 м) от Минской кольцевой автодороги (МКАД). Цель – микробиологический, молекулярно-генетический анализ и оценка деградативного потенциала микроорганизмов из почвы сельскохозяйственного назначения. Установлено, что близкое расположение автомагистрали оказывает негативное воздействие на различные физиологические группы почвенных микроорганизмов за исключением деструкторов нефтепродуктов. Молекулярно-генетический анализ почвенной метагеномной ДНК позволил выявить детерминанты, связанные с утилизацией алканов и нафталина, бактерий родов Rhodococcus и Pseudomonas. Для 42 изолятов исследован спектр утилизируемых углеводородных субстратов. Из них 20 использовали в качестве источника углерода гексадекан, 15 – дизельное топливо, 8 – октан, 5 – о-ксилол, 4 – толуол, 2 – бензол, фенол не утилизировал ни один из исследуемых изолятов. Наибольшим спектром утилизируемых субстратов обладает изолят № 15, выделенный на среде ПДА, что делает его перспективным для использования в природоохранных биотехнологиях.
Информация о статье
Библиографические ссылки
1. Заславский, М. Н. Эрозиоведение. Основы противоэрозионного земледелия / М. Н. Заславский. – М. : Высш. шк., 1987. – 376 с.
2. Янин, Е. П. Ремедиация территорий, загрязненных химическими элементами: общие подходы, правовые аспекты, основные способы / Е. П. Янин // Проблемы окружающей среды и природных ресурсов. – 2014. – № 3. – С. 3–105.
3. Шамраев, А. В. Влияние нефти и нефтепродуктов на различные компоненты окружающей среды / А. В. Шамраев, Т. С. Шорина // Вестн. Оренбург. гос. ун-та. – 2009. – № 6 (100). – С. 642–645.
4. Effects of crude oil, oil components, and biodegradation on plant growth / Baek Kyung-Hwa [et al.] // Journal of Environmental Science and Health, Part A. – 2004. – Vol. 39, iss. 9. – P. 2465–2472.
5. Углеводороды в почвах: происхождение, состав, поведение (обзор) / А. Н. Геннадиев [и др.] // Почвоведение. – 2015. – № 10. – С. 1195–1195.
6. Коломин, В. В. Автотранспорт как приоритетный источник загрязнения атмосферного воздуха (обзор литературы) / В. В. Коломин, В. С. Рыбкин // Естеств. науки. – 2015. – № 1. – С. 26–34.
7. Struzeski, E. J. Jr. Chemical treatment of oil spills / E. J. Struzeski Jr., R. T. Dewling // Proceedings of Joint Conference on Prevention and Control of Oil Spills. – 1969. – Iss. 1. – P. 217–222.
8. Obi, E. O. Techniques of Oil Spill Response in the sea / E. O. Obi, F. A. Kamgba, D. A. Obi // IOSR Journal of Applied Physics. – 2014. – Vol. 6, iss. 1. – P. 36–41.
9. Daniel, R. The metagenomics of soil / R. Daniel // Nature Reviews Microbiology. – 2005. – Vol. 3, iss. 6. – Р. 470–478.
10. Prosser, J. I. Dispersing misconceptions and identifying opportunities for the use of ‘omics’ in soil microbial ecology / J. I. Prosser // Nature Reviews Microbiology. – 2015. – Vol. 13, iss. 7. – Р. 439–446.
11. The choice of the DNA extraction method may influence the outcome of the soil microbial community structure analysis / S. Zielinska [et al.] // Microbiology Open. – 2017. – Vol. 6, iss. 4. – Art. e00453.
12. Семенов, М. В. Метабаркодинг и метагеномика в почвенно-экологических исследованиях: успехи, проблемы и возможности / М. В. Семенов // Журн. общ. биологии. – 2019. – T. 80, № 6. – С. 403–417.
13. Звягинцев, Д. Г. Методы почвенной микробиологии и биохимии : учеб. пособие / Д. Г. Звягинцев. – М. : Изд-во МГУ, 1992. – 304 с.
14. Миллер, Дж. Эксперименты в молекулярной генетике / Дж. Миллер ; пер. с англ. Ю. Н. Зографа [и др.] ; под ред. и с предисл. С. И. Алиханяна. – М. : Мир, 1976. – 436 с.
15. Kloos, K. A new method for the detection of alkane-monooxygenase homologous genes (alkB) in soils based on PCR-hybridization / K. Kloos, J. Ch. Munch, M. Schloter // Journal of Microbiological Methods. – 2006. – Vol. 66, iss. 3. – P. 486–496.
16. Impact of seasonal variations and nutrient inputs on nitrogen cycling and degradation of hexadecane by replicated river biofilms / M. R. Chénier [et al.] // Applied and Environmental Microbiology. – 2003. – Vol. 69, nr. 9. – P. 5170–5177.
17. Detection of genes for alkane and naphthalene catabolism in Rhodococcus sp. strain 1BN / V. Andreoni [et al.] // Environmental Microbiology. – 2000. – Vol. 2, iss. 5. – P. 572–577.
18. Coexistence of two distinct copies of naphthalene degradation genes in Pseudomonas strains isolated from the western Mediterranean region / M. Ferrero [et al.] // Applied and Environmental Microbiology. – 2002. – Vol. 68, nr. 2. – P. 957–962.
19. Разнообразие генетических систем биодеградации нафталина у штаммов Pseudomonas fluorescens / Т. Ю. Измалкова [и др.] // Микробиология. – 2005. – T. 74, № 1. – С. 70–78.
20. PCR primers for detection and characterization of IncP-9 plasmids / R. Krasowiak [et al.] // FEMS Microbiology Ecology. – 2002. – Vol. 42, iss. – P. 217–225.
21. Degradation potential of alkanes by diverse oil-degrading bacteria from deep-sea sediments of Haima cold seep areas, South China Sea / Lyu Lina [et al.] // Frontiers in Microbiology. – 2022. – Vol. 13. – Art. 920067.
22. Nzila, A. Current Status of the Degradation of Aliphatic and Aromatic Petroleum Hydrocarbons by Thermophilic Microbes and Future Perspectives / A. Nzila // International Journal of Environmental Research and Public Health. – 2018. – Vol. 15, iss. 12. – Art. 2782.
23. Hassanshahian, M. Isolation and characterization of crude oil degrading bacteria from the Persian Gulf (Khorramshahr provenance) / M. Hassanshahian, M. S. Zeynalipour, F. H. Musa // Marine Pollution Bulletin. – 2014. – Vol. 82, iss. 1–2. – P. 39–44.
24. Assessing environmental drivers of microbial communities in estuarine soils of the Aconcagua River in Central Chile / S. Fuentes // FEMS Microbiology Ecology. – 2015. – Vol. 91, iss. 10. – Art. fiv110.